在二战风云2游戏中，运输船只至海港需先在己方港口完成船只建造与部队装载，再规划安全航线、配置护航舰队，最后将船只驶入己方或盟友控制的海港完成停靠与卸载，全程要做好资源补给与敌情规避，才能保障运输任务顺利完成。首先要完成港口与船只的基础准备，必须先拥有可运作的港口建筑，港口等级越高，可同时建造与停靠的船只数量越多，也能支持更大吨位的舰船建造。在港口的船坞中选择运输船、驱逐舰、巡洋舰等目标船只进行建造，建造时要确保钢铁、石油、橡胶等资源充足，避免因资源短缺导致建造中断。船只建造完成后，将需要运输的陆军部队、物资装载上船，不同兵种占用的船舱空间不同，步兵占用空间小，坦克、装甲车等重型单位占用空间大，需根据运输需求合理搭配装载，避免空间浪费。装载完成后，在港口界面选中目标船只，即可进入航线规划与航行阶段。
航线规划与航行是运输船只至海港的核心环节，直接决定运输效率与安全性。选中船只后，在战略地图上点击目标海港，系统会自动生成基础航线，玩家可手动调整航线节点，避开敌方舰队巡逻区、潜艇伏击区以及岸防炮覆盖范围。航行前务必用侦察机对航线沿途海域进行侦查，标记敌方海军、空军的活动位置，优先选择友方港口密集、海域视野开阔的路线，减少遭遇战风险。船只航行会持续消耗燃油，长途运输前要在出发港口储备足量燃油，也可在航线中途的友方港口提前囤积燃油，避免舰队中途因燃油耗尽停滞。航行过程中，可采用Z字形行进路线降低被敌方锁定的概率，同时保持舰队阵型，运输船居中，护航舰艇分布在四周，随时应对突发敌情。
护航配置是运输船只安全抵达海港的关键保障，运输船自身防御薄弱，极易成为敌方潜艇、轰炸机的攻击目标，必须搭配合理的护航舰队。常规护航配置以驱逐舰为主，驱逐舰具备优秀的反潜与防空能力，能有效拦截敌方潜艇与战机，数量上每三到四艘运输船搭配两艘驱逐舰，可形成基础防护网。长途或高风险航线，可增加巡洋舰作为护航主力，巡洋舰火力更强、续航更久，能应对敌方中小型战舰的突袭。若航线附近有敌方航母活动，还需配置防空舰或舰载机，抵御敌方轰炸机的空袭。护航舰队要全程伴随运输船队航行，遇到敌方小股部队时，优先由护航舰艇清理，避免运输船直接参战受损；遭遇大规模敌方舰队时，立即调整航线撤离，或呼叫盟友舰队支援，切勿硬拼。
船只抵达目标海港后，需完成停靠与后续操作，才算完成整个运输流程。只有己方或盟友控制的海港才能安全停靠，若目标海港被敌方占领，需先出动舰队攻占海港，摧毁岸防炮与守军，修复港口设施后，才能让运输船只驶入。船只靠近海港时，点击海港建筑选择停靠指令，船只便会自动驶入港口泊位，停靠后可进行部队卸载、物资补给与船只维修操作。卸载部队时，港口会提供快速卸载通道，效率远高于海岸直接登陆，卸载的部队可直接在港口集结，参与后续作战或防御部署。停靠期间，要及时为船只补充燃油与弹药，修复航行中受损的部件，为下一次运输任务做好准备。同时，在港口周边部署防空炮与岸防设施，防止敌方偷袭停靠的舰队，保障港口与船只的安全。
